Зачепилівський ліцей бере свій початок від земської школи, яка була відкрита у 1909 році на кошти Костянтиноградського повітового земства. На той час це була початкова школа, яка відносилася до міністерських двокласних училищ, тому навчання в ній тривало п’ять років. У 1926 році Зачепилівська початкова школа стала семирічною, єдиною на той час у Зачепилівському районі. А вже в 1933 році школа отримала статус середньої, повний курс навчання у ній тривав 10 років. У 1936 році відбувся перший випуск десятого класу – тринадцять хлопців і дівчат стали першими випускниками Зачепилівської середньої школи.
Розпорядженням Зачепилівської районної державної адміністрації Харківської області від 9 липня 2004 року № 183 Зачепилівська загальноосвітня школа І-ІІІ ступенів була реорганізована у навчальний заклад нового типу – ліцей.
Перший директор Зачепилівського ліцею – Буланов Юрій Іванович.
Так Зачепилівська школа пройшла шлях від земського початкового училища до ліцею.
Хроніка досягнень Зачепилівського ліцею:
2005 рік – ІІ місце в обласному огляді-конкурсі на кращу організацію громадянської освіти та виховання у загальноосвітніх закладах Харківської області у номінації «Забезпечення наступності у громадянської освіти та виховання учнів загальноосвітнього навчального закладу»;
2006 рік – лауреат Всеукраїнського конкурсу «100 кращих шкіл України» у номінації «Школа громадянського становлення»;
2006 рік – переможець районного конкурсу «Школа року – 2006», лауреат обласного конкурсу;
2006 рік, листопад - лауреат V регіональної відкритої виставки-конкурсу «Освіта Харківщини ХХІ століття» за темою «Школа року: переможці та лауреати»;
2007 рік, 25-27 квітня – лауреат VІІІ регіональної відкритої виставки-конкурсу «Освіта Харківщини ХХІ століття» за темою «Громадянська освіта та виховання в загальноосвітніх навчальних закладах»;
2007 рік, 11-17 листопада – навчальний візит до Республіки Польща директора ліцею Буланова Юрія Івановича за українсько-польським проектом «Разом для розвитку»;
2007 рік, 6 грудня – участь у презентації досвіду спільної роботи методичних служб та педагогічних колективів Харківської області з громадянського виховання та правової освіти учнівської молоді на Всеукраїнській конференції Асоціації керівників шкіл України (АКШУ) «Взаємодія влади та громадських організацій в освіті, м. Харків;
2008 рік – ІІІ місце в обласному конкурсі-огляді на кращу модель організації співпраці педагогів, батьків та учнів у районах (містах) Харківської області;
2008 рік – участь у Всеукраїнській громадській акції «Флагман сучасної освіти України»;
2009 рік. 21-23 січня – ХІV обласна тематична відкрита виставка ефективного педагогічного досвіду «Освіта Харківщини ХХІ століття» за темою «Дослідно-експериментальна та інноваційна діяльність навчальних закладів як один із факторів підвищення якості освіти», диплом ІІІ ступеня;
2009 рік – лауреат обласного конкурсу «Навчальний заклад року – 2009» у номінації «Загальноосвітня школа року» (увійшли у трійку кращих даної номінації);
2010 рік, травень – відзнака голови Харківської обласної державної адміністрації Добкіна М.М. «Краща школа 2010».
З 12 серпня 2010 року виконання обов’язків директора ліцею покладено на учителя математики Велику В.В. 14 вересня 2010 року директором Зачепилівського ліцею призначена Велика Валентина Вікторівна. У 2016 році Зачепилівський ліцей позбувся статусу ліцею; заклад став називатися Зачепилівська загальноосвітня школа І-ІІІ ступенів. 2017 року директором стала Коржевич Світлана Євгенівна. У грудні 2018 року директором школи на конкурсній основі став Буланов Юрій Іванович. З 1 вересня 2022 року заклад отримав назву Комунальний заклад «Зачепилівський ліцей».